三点区别：
一、招考对象不同
(一)三支一扶
招募对象主要为全国普通高校应届毕业生，并应具备以下条件：
1.政治素质好，热爱社会主义祖国，拥护党的基本路线和方针政策;
2.学习成绩合格，具有相应的专业知识;
3.具有敬业奉献精神，遵纪守法，作风正派;
4.身体健康。
(二)公务员
乡镇公务员分为定向和非定向。定向乡镇公务员一般面向优秀村社干部、工人、农民和大学生村官等基层项目人员。对考生学历要求较低(大专及以上学历)，专业限制范围也较小。
如云南的定向乡镇公务员，只面向村社干部和大学生村官，广东的乡镇公务员，应往届毕业生、三支一扶、大学生村官等都能报考。
公务员的报考年龄一般在18-35周岁，优秀的、受到表彰的优秀村干部可放宽到38-40周岁。但要注意，报考也要建立在取得要求的学历基础之上。
二、行政性质不同
(一)三支一扶
大学生毕业后到农村基层从事支教、支农、支医和扶贫工作，促进农村基层社会事业发展，简称“三支一扶”。工作时间一般为2年，工作期间给予一定的生活补贴。工作期满后，自主择业，择业期间享受一定的政策。
三支一扶人员不是公务员。但每年公务员招考会单独拿出一部分岗位，专门招录三支一扶、大学生村官等考生。
(二)公务员
公务员顾名思义，从属于国家公务员，所以具有国家公务员身份和编制，并享有国家公务员相关政策及福利待遇等。
三、薪资待遇不同
(一)三支一扶
“三支一扶”工资按当地乡镇机关或事业单位工资收入水平来确定的，中央财政也会进行补贴，西部、中部、东部分别为每年2.5万元、1.8万元、0.8万元。
1.服务期间由省“三支一扶”办按月发放1400元生活补贴(含交通补贴，下同)，统一办理社会保险，并享受每人每年200元的人身意外伤害保险。各设区市组织的“三支一扶”计划可参照省级标准执行。
2.到纳入县级基本财力保障范围的县(市、区)的乡(镇)参加“三支一扶”的高校毕业生，其在校期间的国家助学贷款本息，由服务县(市、区)财政按每年2000元代为偿还。各高校要根据自身特点，结合实际制定鼓励和引导高校毕业生参加“三支一扶”等服务基层项目的具体措施。
(二)公务员
公务员工资及待遇都是由本级财政负担的。工资一般分成四块，职务、级别、津贴、补贴。前两项都一样，差别在后两项。这两块根据不同的财政情况会有差别的，但一般在县域内没有差别。因各省经济乃至财政情况不同，故同职称所对应的薪资待遇还是具有一定差异性的。
